L'univers sonore de Naruto n'est pas vraiment réputé pour sa grande finesse et sur DS pas plus qu'ailleurs (le contraire aurait été très étonnant). Moins diversifiées que bruyantes, les pistes musicales tournent en boucle sans que l'on fasse finalement trop attention à elles. En revanche, supporter longtemps les "hu!" et les "yo!" qui "égayent" les séquences de transition est une autre paire de manches.